Bioinformática aplicada à sistemática, biogeografia e macroevolução

Novembro / 2018

Medições

Para realizar medições no imageJ é preciso calibrar a escala. Posteriormente, é só selecionar a medida a ser tomada e clicar “Analyze” –> “Measure” ou CTRL+M. Além de medidas lineares também é possível medir a área de estruturas (dentre outras medidas).

  • Vá em “Analyze” –> “Set measurements” para ver todas as opções

Faça uma linha sobre a área da escala

Cliquem em “Set scale”

Digite o valor correspondente da sua escala

Selecione a região a ser medida e digite CTRL+M para registrar o valor

É possível exportar uma tabela com as medidas.

Veja também “Set global scale”

Batch

No imageJ é possível também rodar um script. O jeito mais fácil de gerar um script é com o auxílio da função “Macro” –> “Record”. A ideia é que vc execute os comandos de interesse em uma imagem. Tais comandos irão ficar gravados e você pode simplesmente colá-los no seu script.

Execute os comandos

Copie os comandos do “Record”

E use-os para rodar o seu script em batch mode

Outras funcionalidades

  • stacks
  • inúmeras outras (ver tutoriais)